Em toda a Ásia, a principal ameaça à sobrevivência da espécie é a destruição dos seus habitats para a criação e desenvolvimento comercial e residencial. O aumento do uso de pesticidas nos cursos de água - provenientes das plantações - reduz a qualidade dos habitats existentes. Paralelamente, a diminuição de presas (alimento) é também um importante fator, que torna insustentável os habitats naturais remanescentes.
A caça furtiva continua a ser muito significativa em muitas partes da Índia e do Sudeste Asiático, sobretudo para a obtenção de peles, representando uma forte ameaça que deve ser objeto de um acompanhamento constante. Outra ameaça registada é o crescente comércio ilegal para uso de Lontras-asiáticas como animais de estimação. Atualmente, grande parte deste comércio é feito online, o que dificulta ainda mais o seu controlo.
