A sua população encontra-se estável, contando com cerca de 20000 a 45000 aves adultas. No entanto, é ameaçada pela caça e pela perturbação causada pelo turismo nos locais de nidificação. A íbis-sagrada é também suscetível ao botulismo aviário, pelo que pode ser ameaçada por surtos desta doença. Considerada uma espécie sagrada no Antigo Egito, está hoje extinta no país. Contudo, é considerada uma espécie invasora em vários países da Europa, onde foi introduzida pelo Homem.