A população mundial de águias-reais encontra-se estável, registando-se mais de 85 mil indivíduos adultos. Contudo, segundo o Livro Vermelho dos Vertebrados de Portugal, no nosso país esta espécie encontra-se Em Perigo. As maiores causas de ameaça no nosso território são: a colisão e electrocução em linhas aéreas de energia; a caça; a utilização de iscos envenenados; a diminuição das populações de Coelho-bravo (alimento); a alteração de diversas práticas agropecuárias tradicionais; a perturbação humana em zonas de nidificação (provocada por atividades agro silvícolas e cinegéticas, turismo e lazer) e a construção de infraestruturas (barragens, parques eólicos, estradas). A falta de sensibilidade ambiental por parte da população rural, que encaram esta espécie como um entrave para algumas atividades, é a causa de conflitos que levam à perseguição destes animais.